9 settembre 2013 Grazie a ottime prestazioni in questo scorcio di stagione – secondo alla Tre Valli Varesine e terzo nella classifica finale della Settimana Lombarda – il giovane 23enne Bongiorno, portacolori della Bardiani-CSF, strappa la leadership a Diego Ulissi nella classifica provvisoria dedicata agli atleti under 25. Bongiorno è anche terzo nella classifica individuale assoluta.
Classifica giovani dopo 15 prove
| Num. | Nome | Gruppo Sportivo | Punti |
| 1 | BONGIORNO Francesco Manuel* | Bardiani-CSF | 146 |
| 2 | ULISSI Diego* | Lampre-Merida | 135 |
| 3 | ARU Fabio* | Astana | 89 |
| 4 | FELLINE Fabio* | Androni Giocattoli | 42 |
| 5 | BATTAGLIN Enrico * | Bardiani-CSF | 41 |
| 6 | SAGAN Peter* | Cannondale | 40 |
| 7 | LOCATELLI Paolo * | Bardiani-CSF | 34 |
| 8 | ZILIOLI Gianfranco* | Androni Giocattoli | 33 |
| 9 | BARBIN Enrico* | Bardiani-CSF | 29 |
| 10 | SBARAGLI Kristian* | MTN-Qhubeka | 26 |
| 11 | FEDI Andrea* | Ceramica Flaminia-Fondriest | 21 |
| 12 | ZARDINI Edoardo* | Bardiani-CSF | 18 |
| 13 | CECCHIN Alberto* | Nippo-De Rosa | 18 |
| 14 | ZORDAN Andrea* | Androni Giocattoli | 13 |
| 15 | ROSA Diego* | Androni Giocattoli | 13 |
| 16 | FAVILLI Elia* | Lampre-Merida | 11 |
| 17 | ALAFACI Eugenio* | Leopard Trek-Continental | 11 |
| 18 | MOSER Moreno* | Cannondale | 10 |
| 19 | COLBRELLI Sonny* | Bardiani-CSF | 9 |
| 20 | BOEM Nicola* | Bardiani-CSF | 6 |
| 21 | BERTAZZO Omar* | Androni Giocattoli | 5 |
| 22 | ROMERO CORREDOR Jeffry Johan* | Colombia | 5 |
| 23 | BONIFAZIO Nicolo’* | Lampre-Merida | 5 |
| 24 | POLANC Jan* | Lampre-Merida | 5 |
| 25 | NIZZOLO Giacomo* | Radioshack-Leopard | 5 |
| 26 | RODRIGUEZ GALINDO Michael* | Colombia | 5 |
| 27 | BALLONI Alfredo* | Ceramica Flaminia-Fondriest | 2 |
| 28 | MANFREDI Andrea* | Ceramica Flaminia-Fondriest | 1 |